В первую очередь необходимо понять задачи вашего сервера и рассчитать или выявить самые узкие-требовательные места.
Во вторую очередь обратите внимание на оперативную память, особенно для проектов с виртуализацией, а также удаленных рабочих столов или приложений - возможность расширения оперативной памяти, является решающим фактором;
В третью очередь обратите внимание на скорость чтения и записи жестких дисков, для выбора серьезных проектов (например более 70 пользователей сервера 1С Предприятия), следует выбрать уже полноценную СХД и RAID10 с повышенной производительностью;
И в четвертую очередь необходимо учесть ресурс выбранных устройств, если проект серьезный и на отказоустойчивость следует обратить внимание, то необходимо предусмотреть кластер или возможность быстрой или приемлемо быстрой замены.